應(yīng)土壤環(huán)境與生態(tài)研究組吳金水研究員邀請，國際著名土壤微生物學(xué)家，我所外籍特聘研究員，西澳大學(xué)、中澳土壤生物系統(tǒng)聯(lián)合實驗室教授Andrew Whiteley及Deepak Kumaresan博士于2014年10月20–30日訪問我所，開展“下一代環(huán)境組學(xué)數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)研討會（Bioinformatics for Next Generation Environmental data）”及土壤微生物前沿研究的學(xué)術(shù)講座與交流，并討論雙邊合作事宜。
其學(xué)術(shù)報告安排如下，歡迎各位老師和同學(xué)參加。
10月21日 (星期二)
9:00-10:30 MicroBlitz: One year on and what have we learned about Citizen Science and our environment? (Prof. Andrew Whiteley)
10:30-10:45 Tea and coffee break
10:45-12:00 Microbial life in Movile Cave (Romania) – an unusual cave ecosystem
(Dr. Deepak Kumaresan)
報告地點：所一樓會議室
聯(lián)系人：王娟、葛體達
10月22日 (星期三)
Workshop on Bioinformatics for Next Generation Environmental data
9:00-11:30 Qiime-based analysis of 16S rRNA gene amplicon sequences
14:30-16:30 Next-generation sequence analysis of functional gene sequences
16:30-17:30 Hands-on experience and discussion
10月23日 (星期四)
Workshop on Bioinformatics for Next Generation Environmental data
9:00-11:30： Shot-gun metagenome sequence analysis using MG-RAST platform
14:30-16:30 Shot-gun metagenome sequence analysis using IMG platform and other tools
16:30-17:30 Hands-on experience
* User-group formation and discussion (4-5 groups depending on the number of participants)
10月24日 (星期五)
Workshop on Bioinformatics for Next Generation Environmental data
9:30-11:30 User-group discussions
14:30-17:30 User-group presentations
*We can choose to use our own sequences or can use publicly available sequences from MG-RAST or IMG.
地點：所206會議室
聯(lián)系人：王娟、葛體達
Andrew Whiteley在我們所的詳細日常安排見附件。
歡迎各位老師、同學(xué)參加討論！
報告人簡介：
Prof. Dr. Andrew Whiteley教授，西澳大學(xué)State’s newest Premier’s Fellow，他的研究主要圍繞陸地、海洋和極地環(huán)境微生物多樣性進行，應(yīng)用DNA編碼技術(shù)解析土壤微生物種群、建立“健康”和“退化”環(huán)境的分子微生物指紋圖譜。在進入西澳大學(xué)之前，他在牛津大學(xué)建立了國際著名分子生態(tài)學(xué)實驗室，率先開發(fā)了RNA穩(wěn)定同位素探針、“格里菲斯”DNA和RNA共提取方法等技術(shù)，奠定了商品化試劑盒和基于Raman的微生物細胞的顯微鏡技術(shù)的基礎(chǔ)。最近他負責(zé)了世界上第一個5km分辨率的國家尺度上的微生物多樣性圖譜，以及相關(guān)的土壤健康、環(huán)境因素和地理特征。同時，他還致力于研究環(huán)境DNA研究的民眾參與機制。比如他領(lǐng)導(dǎo)的民眾科學(xué)項目中的“微晶石”計劃（MicroBlitz），通過收集和遞交澳大利亞公民DNA序列的樣本用來微生物多樣性圖譜的繪制。在Nature等期刊發(fā)表了有關(guān)分子微生物生態(tài)學(xué)論文80多篇。文章引用超過5000多次，H指數(shù)為40，i指數(shù)(論文引用次數(shù)超過10次的)為72。