近日，中國工程院院士、中科院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所研究員印遇龍團隊牽頭，聯(lián)合湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)、華智生物技術(shù)有限公司科研團隊，利用cGPS靶向測序技術(shù)合作開發(fā)了首款適用于湘豬等地方豬的64K cGPS育種液相芯片。
當(dāng)前，地方豬品種的種質(zhì)資源保護和良種選育工作較為落后，導(dǎo)致地方豬的繁殖、肉質(zhì)、抗逆性等優(yōu)良性狀退化，且地方豬生長速度慢，嚴重影響經(jīng)濟效益。利用高效的現(xiàn)代分子育種技術(shù)和工具，多維度、多層次開發(fā)和利用地方豬優(yōu)異種質(zhì)資源是振興地方豬產(chǎn)業(yè)的重要舉措。
64K cGPS育種液相芯片位點多態(tài)性好、基因組分布均勻。研究團隊通過選擇多樣性豐富的湖南地方豬種和廣東地方豬種，基于其全基因組重測序數(shù)據(jù)，篩選到湖南、廣東地方豬種中高多態(tài)位點64K，均勻覆蓋全基因組。結(jié)果顯示，利用該芯片在豬早期進行分子標記輔助育種選擇，能很好地提高生豬育種效率。
該芯片還有品種特異性位點及功能位點豐富的特點，包含寧鄉(xiāng)豬和廣東豬等品種特異性位點，囊括背膘厚、肉質(zhì)等功能分子標記位點256個，可進行背膘厚、肉質(zhì)等重要性狀基因的挖掘利用，產(chǎn)品技術(shù)參數(shù)優(yōu)良。經(jīng)樣本測試，該產(chǎn)品位點檢出率高，平均檢出率為99.23%；產(chǎn)品穩(wěn)定性好，重復(fù)樣本基因型平均一致率為99.31%，整體性能優(yōu)良。
印遇龍表示，該芯片的廣泛應(yīng)用將有效提高地方豬重要性狀遺傳基礎(chǔ)解析和優(yōu)異基因資源挖掘的準確性，提升生豬核心種源自主選育的效率，引領(lǐng)現(xiàn)代特色優(yōu)質(zhì)生豬種業(yè)發(fā)展，對推動生豬產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要戰(zhàn)略意義。